・送客手数料がかかる

OTAは初期費用や月々の固定費用がかからないものの、宿泊実績に応じて15%程度の手数料が発生します。予約が増えるほど、この手数料も増えるため、利益を圧迫していきます。自社サイトからの直接予約では送客手数料はもちろんかかりませんので、この送客費用の負担は大きいデメリットと言えます。

・キャンセルリスクが高まる

24時間365日予約受付可能な点がOTAの魅力ですが、操作が簡単な分、気軽にキャンセルされてしまう場合も多くあります。直前でのキャンセルやノーショウ（無断不泊）によって、損失が出てしまうこともあるでしょう。ホテル側はOTA側のシステムに依存しているため、直接対応できず、キャンセルや変更の取り扱いに時間がかかることもあり、お客様からのクレームの一因となってしまう可能性が出てきます。

・ブランドの独立性が保ちにくい

OTAの掲載方法は平準化されており、ルールに則って掲載する必要があります。OTAに載せるホテル情報に工夫を凝らせないので、ホテルの魅力が十分に出し切れず、OTAのサイトで宿泊施設が検索結果に埋もれやすくなり、施設の独自性や個性が伝わりにくくなります。その他にもOTA 側が宿泊施設に対して、自社との契約内容が最も良い条件にすることを取り決める最恵待遇条項を求めてくるなど、宿泊料金も自由に決定できなくなってしまう恐れがあります。

・低価格競争になりやすい

OTAでは掲載方法は平準化されているので、利用者にとってはどこも同じようなホテルに見えてしまい違いが伝わりにくく、もっともわかりやすい価格で選ばれてしまう傾向があり、競合との低価格競争が避けられません。その結果、稼働率が上がり利益率が低下するといった悪循環が生じるというデメリットがあります。